用 Ephemeral Storage 加速 MySQL over ZFS 的效能

Percona 的「MySQL/ZFS in the Cloud, Leveraging Ephemeral Storage」這篇裡面在探討是不是可以看看 ZFS 在 Ephemeral Storage (機器附的本地硬碟) 上的效能。

一開始測試是直接當主力硬碟來測,可以看到跑 ZFS 的情況下,本地的 storage 還是會比 SSD Premium (這是 Azure 的產品線) 還快不少:

但把資料放在本地的 storage 上其實有點刺激,至少在 production 應該不太會這樣搞,所以後面用 L2ARC 的方式來測,可以看到效率提昇相當明顯,甚至接近本來直接把資料放在本地的 storage:

另外測了 ext4/bcache,看起來效率就沒那麼好:

這樣看起來是個不錯的選擇...

MySQL InnoDB 的 OPTIMIZE TABLE 的 Lock

Backend Twhttps://www.facebook.com/groups/616369245163622/posts/2467225396744655/ 這邊看到:

先大概回答一下假設,DELETE 後的空間是可以被同一個表格重複使用的,所以應該是還好,不過離峰時間跑一下 OPTIMIZE TABLE 也沒什麼關係就是了。

裡面提到的「13.7.2.4 OPTIMIZE TABLE Statement」(MySQL 5.7 文件) 以及「13.7.2.4 OPTIMIZE TABLE Statement」(MySQL 5.6 文件) 都有講到目前比較新的版本都已經是 Online DDL 了:(這邊抓 5.6 的文件,有支援的版本資訊)

Prior to Mysql 5.6.17, OPTIMIZE TABLE does not use online DDL. Consequently, concurrent DML (INSERT, UPDATE, DELETE) is not permitted on a table while OPTIMIZE TABLE is running, and secondary indexes are not created as efficiently.

As of MySQL 5.6.17, OPTIMIZE TABLE uses online DDL for regular and partitioned InnoDB tables, which reduces downtime for concurrent DML operations. The table rebuild triggered by OPTIMIZE TABLE is completed in place. An exclusive table lock is only taken briefly during the prepare phase and the commit phase of the operation. During the prepare phase, metadata is updated and an intermediate table is created. During the commit phase, table metadata changes are committed.

文件上有提到會有一小段 lock 的時間,不過一般來說應該不會造成太大問題。

這邊要講的是早期的經典工具 pt-online-schema-change (pt-osc),這是使用 TRIGGER-based 的方式在跑,他的範例就直接提供了一個不需要 Online DDL 支援的版本:

Change sakila.actor to InnoDB, effectively performing OPTIMIZE TABLE in a non-blocking fashion because it is already an InnoDB table:

pt-online-schema-change --alter "ENGINE=InnoDB" D=sakila,t=actor

這在早期的時候還蠻常被拿出來用的,如果還在維護一些舊系統的話還蠻推薦的...

MySQL 跑在 ZFS 與 ext4 的效能差異

Percona 的「MySQL/ZFS Performance Update」這篇又對 ZFS 做了一次測試,算是用比較新的軟體跑出來的結果,不過要注意這邊的 ZFS 版本仍然不是目前最新版:

ZFS 0.8.6-1 is not bleeding edge, there have been more than 1700 commits since and after 0.8.6, the ZFS release number jumped to 2.0. The big addition included in the 2.0 release is native encryption.

機器是在雲端上 (Azure 上),不熟悉 Azure 的機種,但看記憶體與 CPU 的量好像不是用頂規的機器:

benchmark host
Standard D2ds_v4 instance
2 vCpu, 8GB of Ram and 75 GB of temporary storage
Debian Buster

Database host
Standard E4-2ds-v4 instance
2 vCpu, 32GB of Ram and 150GB of temporary storage
256GB SSD Premium (SSD Premium LRS P15 – 1100 IOPS (3500 burst), 125 MB/s)
Debian Buster
Percona server 8.0.22-13

跑出來的結果看起來不差:

看了一下測試用的設定,似乎只測了 compression 的部份,沒測 snapshot 以及其他功能會對效能有什麼影響,但至少基本盤應該是還不錯?

Percona XtraDB Cluster (PXC) 節點離開太久後的惡搞法

Percona 的「How To Recover Percona XtraDB Cluster 5.7 Node Without SST」這邊看到的技巧,不過只能用在 5.7 版,不能用在 8.0 版。我猜這個方法也可以用在其他跑 Galera Cluster 的資料庫上...

維護一組 Percona XtraDB Cluster 時一個常見的問題是,當節點離線太久後有機會無法用 IST (Incremental State Transfer) 跟回來,也就是只要把先前還沒有同步的部份更新進資料庫的方法,這時候就會需要用 SST (State Snapshot Transfer),變成抓整個 full copy。

作者提出來的方法是基於 IST 的大小通常比較小,但 binlog 通常都留蠻久的,所以可以利用 binlog 來幫 IST。

方法是先把 Galara Cluster 關掉,用 MySQL 傳統的 replication 同步到一定程度後,再把 IST 相關的位置設定指到已經同步的位置,接著再把 Galara Cluster 接上去就可以恢復了。

這個方法是 5.7 版限定,因為 8.0 的年代沒辦法改 Galara Cluster 的 wsrep 位置資訊:

Unfortunately, a similar solution does not work with Percona XtraDB Cluster 8.0.x, due to the modified way wsrep positions are kept in the storage engine, hence the trick with updating grastate.dat does not work as expected there.

我覺得可能 Percona 之後會弄出 patch 讓使用者可以改...

把 blog 搬到 t4g.small 上

算了一下成本還可以接受 (機器 + 空間 + 流量),就把 blog 搬到 AWSt4g.small (ARM) 上,理論上頁面的速度應該會快不少,過幾天等穩定性沒問題後就來買 RI...

x86-64 轉到 ARM 上面,主要是 Percona Server 目前沒有提供 ARM binary 的 apt repository,所以就改用 MariaDB 了。

其他的倒是都差不多,目前的 Ubuntu + nginx + PHP 沒什麼問題,跑一陣子看看...

Eventbrite 的 MySQL 升級計畫

在 2021 年看到 EventbiteMySQL 升級計畫:「MySQL High Availability at Eventbrite」。

看起來是 2019 年年初的時候 MySQL 5.1 出問題,後續決定安排升級,在 2019 年年中把系統升級到 MySQL 5.7 (Percona Server 版本):

Our first major hurdle was to get current with our version of MySQL. In July, 2019 we completed the MySQL 5.1 to MySQL 5.7 (v5.7.19-17-log Percona Server to be precise) upgrade across all MySQL instances.

然後看起來是直接在 EC2 上跑,不過這邊提到的空間問題就不太確定了,是真的把 EBS 的空間上限用完嗎?比較常使用的 gp2gp3 上限都是 16TB,不確定是不是真的用到接近爆掉了:

Not only was support for MySQL 5.1 at End-of-Life (more than 5 years ago) but our MySQL 5.1 instances on EC2/AWS had limited storage and we were scheduled to run out of space at the end of July. Our backs were up against the wall and we had to deliver!

另外在升級到 5.7 的時候,順便把本來是 INT 的 primary key 都換成 BIGINT

As part of the cut-over to MySQL 5.7, we also took the opportunity to bake in a number of improvements. We converted all primary key columns from INT to BIGINT to prevent hitting MAX value.

然後系統因為舊版的 Django 沒辦法配合 MySQL 5.7,得升級到 Django 1.6 (要注意 Django 1 系列的最新版是 1.11,看起來光是升級到 1.6 勉強會動就升不上去了?):

In parallel with the MySQL 5.7 upgrade we also Upgraded Django to 1.6 due a behavioral change in MySQL 5.7 related to how transactions/commits were handled for SELECT statements. This behavior change was resulting in errors with older version of Python/Django running on MySQL 5.7

然後採用了 GitHub 家研發的 gh-ost 當作改變 schema 的工具:

In December 2019, the Eventbrite DBRE successfully implemented a table ALTER via gh-ost on one of our larger MySQL tables.

看起來主要的原因是有遇到 pt-online-schema-change 的限制 (在「GitHub 發展出來的 ALTER TABLE 方式」這邊有提到):

Eventbrite had traditionally used pt-online-schema-change (pt-osc) to ALTER MySQL tables in production. pt-osc uses MySQL triggers to move data from the original to the “duplicate” table which is a very expensive operation and can cause replication lag. Matter of fact, it had directly resulted in several outages in H1 of 2019 due to replication lag or breakage.

另外一個引入的技術是 Orchestrator,看起來是先跟 HAProxy 搭配,不過他們打算要再換到 ProxySQL

Next on the list was implementing improvements to MySQL high availability and automatic failover using Orchestrator. In February of 2020 we implemented a new HAProxy layer in front of all DB clusters and we released Orchestrator to production!

Orchestrator can successfully detect the primary failure and promote a new primary. The goal was to implement Orchestrator with HAProxy first and then eventually move to Orchestrator with ProxySQL.

然後最後題到了 Square 研發的 Shift,把 gh-ost 包裝起來變成有個 web UI 可以操作:

2021 還可以看到這類文章還蠻有趣的...

產生名次的 SQL

Percona 的「Generating Numeric Sequences in MySQL」這篇在討論產生字串序列,主要是在 MySQL 環境下,裡面看到的技巧「Session Variable Increment Within a SELECT」這組,剛好可以用在要在每個 row 裡面增加名次:

SELECT (@val := @val + 1) - 1 AS value FROM t1, (SELECT @val := 0) AS tt;

另外看到 MariaDBMySQL 8.0 系列因為有多支援各種功能,剛好也可以被拿來用,然後最後也提到了 Percona 自家出的 MySQL 8.0.20-11 將會直接有 SEQUENCE_TABLE() 可以用 (這應該才是 Percona 這篇文章的主要目的,推銷一下自家產品的新功能)。

文章收起來之後遇到可以拿出來參考用...

Percona 對 MongoDB 的建議

看到「5 Things DBAs Should Know Before Deploying MongoDB」這篇,裡面給了五個建議,其中第五點頗有趣:

5) Whenever Possible, Working Set < RAM

As with any database, fitting your data into RAM will allow for faster reads than from disk. MongoDB is no different. Knowing how much data MongoDB has to read in for your queries can help you determine how much RAM you should allocate to your database.

這樣的設計邏輯很奇怪啊,你不要扯其他 database 啊,你們家主力的 InnoDB 一直都沒有推薦要 Working Set < RAM 啊,反過來才是用 InnoDB 的常態吧,而且在 PostgreSQL 上也是這樣吧 XDDD

現在上面的文章真的是挑著看了... XD

MariaDB 的 S3 Engine 效能測試

PerconaMariaDB 在 10.5 (目前的最新穩定版) 裡出的 S3 Engine 給出了簡單的測試報告:「MariaDB S3 Engine: Implementation and Benchmarking」。

這個 engine 顧名思義就是把資料丟到 Amazon S3 上,目前是 alpha 版本,預設是不會載入的,需要開 alpha flag 才能用:

The S3 engine is READ_ONLY so you can’t perform any write operations ( INSERT/UPDATE/DELETE ), but you can change the table structure.

另外這是從 Aria 改出來的 read-only engine,而 Aria 是從 MyISAM 改出來的:

The S3 storage engine is based on the Aria code and the main feature is that you can directly move your table from a local device to S3 using ALTER.

測出來發現在 read-only 的情境下,COUNT(*) 超快,看起來就是跟 MyISAM 體系有關,直接撈 MyISAM 內的資料,所以本地要 18 秒,但放到 S3 反而秒殺 XDDD

整體看起來還不錯?算是一種 Data warehouse 的方案,主要是要用到 row-based format 儲存的優點,遇到一些冷資料可以這樣玩。

從「Using the S3 Storage Engine」這邊的設定方式看到 s3_host_name,看起來有機會接其他家的 S3 API,或是本地的 Storage。

話說 Aria 這個引擎當初最主要的重點就在 crash-safe,在有了 crash-safe 之後,DRBD 這種 block-level replication 機制就可以硬幹上去,後來主力就在擴充其他型態了,像是 GIS 與 virtual column 的功能,不過這些功能本家在 InnoDB 上好像也都陸陸續續跟上來了,單純的 Aria engine 好像還好...

Multithreading 版本 pt-online-schema-change

看起來是個嘗試,Percona 的人試著修改 pt-online-schema-change,讓他可以在 INSERT 時 multi-threading,然後看效果:「Multithreaded ALTER TABLE with pt-online-schema-change and myloader」。

可以看出來 thread 夠多的情況下其實都變快不少 (上圖主要是看絕對數字,下圖是看相對比率):

如果沒有意外的話應該會有更多的測試,而這些測試沒問題的話,之後的官方版本裡面應該就會有這個功能。